Proteiiniyhdistelmä sisältää proteiinia useammasta proteiinin lähteestä. Proteiiniyhdistelmä saattaa koostua esimerkiksi heraproteiinista, kaseiinista ja soijaproteiinia. Proteiiniyhdistelmä mahdollistaa proteiinien imeytyminen elimistöön eri vaiheissa ja antaa jatkuvan aminohappovirran lihaksiin pitkäksi aikaa. Nopeasti imeytyvien proteiinien vaikutus on anabolinen sillä se stimuloi proteiinisynteesiä. Hitaammin imeytyvä proteiinit vähentävät proteiinihajontaa ja niiden vaikutus on enemmänkin anti-katabolinen. Eri imeytymisnopeuksien johdosta yhdistelmäproteiini sopii loistavasti välipalaproteiiniksi.